崇祯末年，积弊已久的大明，内有李自成为首的农民起义，外有关外的满清虎视眈眈。加上重大政治，军事，人事决策处理失当。明亡。清军入关，这些游牧民族的入侵者最初以抢夺和奴役为目的，对汉族军民大肆屠戮，发布“留头不留发，留发不留头”的剃发令，以杀戮数千万汉民族人民制造无数屠城血案来确立它的满洲优先民族政策,剃发易服，圈地投充，逃人等民族歧视压迫政策使得最广大的中国人民沦为满洲贵族的奴隶。人类历史上这次大规模的最血腥的屠杀持续了几十年,造成千万人流离失所妻离子散，财产消亡甚至失去生命,人民生活陷入无限痛苦。
清廷统治者从努尔哈赤、皇太极到多尔衮，都以凶悍残忍著称于史。他们一遇抵抗，破城得地之后不分军民，不论参与抵抗或未参与抵抗，通通屠杀或掠取为奴婢。顺治二年四月清廷遣兵南下，即大肆屠戮汉人，演出了一幕幕惨绝人寰的屠城悲剧。多尔衮曾代表满洲贵族发布“屠城令”，并带领大军血洗江南、岭南。屠江阴、屠昆山、屠嘉兴、屠常熟、屠海宁、屠广州、屠赣州等等，甚至勾结荷兰殖民者，攻屠厦门。当时清军几乎将四川人杀绝，后来不得不“湖广填四川”，大移民。 清军屠昆山的时候，有妇女千人藏匿在昆山顶上。有个小孩忍不住哭出声来，被清军发现，于是“搜戮殆尽，血流奔泻，如涧水暴下”。 1645年4月， 清军围攻扬州，清军诱降遭严词拒绝。清军攻城，历七昼夜。25日城破，清军纵兵屠戮，“十日不封刀”，八十多万汉人惨遭杀害。 1645年，清朝颁布剃发令后，江阴(在今江苏)人民举行了反清起义，高呼，“头可断，发决不可剃”，进行反清斗争。清廷先后调动24万军队攻城，江阴人民浴血奋战，守城81天，击毙清三王十八将，清军死伤过十万。但终因力量悬殊，粮食罄尽，守城者全部壮烈牺牲。城破后遭到清军血腥屠杀，繁华的街市尽为废墟。
清兵转战烧杀37载，方才初步平定中国；短短三十余年间，使中国人口从明天启三年的5165万减至顺治十七年的1900万，净减三分之二！整个中国“县无完村，村无完家，家无完人，人无完妇”。在杀尽汉人的骨气廉耻的血腥恐怖中”。位于东南沿海的福州，由于是南明抗清的中心，后又有清军的“迁界禁海”令，境况更是悲惨。仅福建一省就有数百万人死于清军的屠刀。其中包括包括杨玉璇的家人。作为一个有良知的文人当然不会因为自己的屈辱而忘记汉族大明子民的身份，决不接受剃发，易服等一系列亡国奴的羞辱，臣服于满清。而是以文人士大夫的通常方式，隐居山林。从传说其几十年不剃发，易服可以看出大师对民族气节和故国的坚守。他选择在他从前采石时发现的距寿山十五华里的加良山顶一个山洞隐居下来。他陷入对人民悲惨的现状和民族未来的深深思考，期间他参悟佛法并从中找到慰籍。并将他感悟在他以后的作品中加以表现。这段时间他的作品具有浓厚的佛教色彩。在他的作品中他化身具有佛法威力的罗汉降服满清的兽性之狮（暗喻清军）。那大慈大悲的观音表现他对黎民百姓的生灵涂炭寄予深深的同情，那闪耀着人性光辉对普罗大众的博爱也在他的作品中表现无遗。在他的作品中不仅实现对技法，表现内容上的超越，同时也体现了一个中国文人对民族的忠诚和热爱。实现从自我(小我)到民族大众（大我）的人生境界的超越。